根据微生物在除臭作用中的存在形式，处理方法主要分为生物过滤法和生物吸收法，生物膜除臭技术正是结合了这两种方法，可以有效的去除污水处理厂等恶臭物质。
1、生物过滤法
生物过滤法除臭是目前研究最多、工艺最成熟、应用最广泛的生物除臭方法。该除臭法是在适宜条件下，使收集到的废气在通过长满微生物的填料，臭源物质先被填料吸收，然后被其上的微生物氧化分解为二氧化碳和水，由此臭味除去。除臭过程中，固体载体上生长的微生物承担着物质转换的重要任务，微生物生长需要足够的有机养分，所以固体载体中应含有一定浓度的有机物质。同时为保持微生物的活性，必须为其创造良好的生存环境，在操作过程中应注意控制温度、湿度、pH、养份等指标。
2、生物吸收法
生物吸收法(也可称为生物洗涤法)多采用活性污泥的方法，先将恶臭成分转移到水中，然后，再将受污染的水进行微生物处理。按气液接触方式分为两种形式：曝气式和洗涤式。曝气式与污水处理厂的生物曝气类似，只是用臭气代替空气注入活性污泥中，所用的垃圾除臭设备通常是曝气罐，风量为0.1～1 mm/s。该方法适用各种不同的恶臭气体，效果较好，其去除率与污泥的浓度、pH、溶解氧(DO)、曝气强度有关。
3、生物洗涤法
生物洗涤法是利用微生物、营养物和水组成的微生物吸收液来处理废气，此法适合吸收可溶性气态物。吸收废气的微生物混合液再进行好氧处理，去除液体中吸收的污染物，经垃圾除臭设备处理后的吸收液可以重复利用。在生物洗涤法中，微生物及其营养物配料存在于液体中，气体中的污染物通过与悬浮液接触后转移到液体中被微生物降解。
